Галактический экспресс 999 – манга комикс, созданный Мацумото Лайдзи, и ставший впоследствии основой для разнообразных фильмов, сериалов, мультфильмов, видеоигр. Этот комикс рассказывает о будущем мире, в котором люди достигли высот в технических и научных достижениях, и научились передавать свои умы (но не эмоции) в специальные механические организмы, таким образом, достигая бессмертия.
События комикса развиваются вокруг 12-летнего уличного мальчишки Тецуро Хосино, который отчаянно хочет для себя крепкий механический корпус, что предоставило ему способность жить всего и быть свободным. Тем временем механические корпуса, являясь очень дорогими, недоступны Тецуро, но мальчик узнает, что их бесплатно раздают в Галактике Андромеда, на конечной станции Галактического Экспресса 999, космического поезда, который проходит через Землю один раз в год.
Тецуро и его мама направляются в Мегаполис, чтобы найти работу и суметь заплатить за билеты на экспресс. Но по дороге Граф Меча и его банда «охотников на людей» убивают мать Тецуро, но она успевают сказать своему сыну обязательно продолжить путь, получить механический корпус и прожить вечную жизнь, то, чего не смогла получить она. Тецуро намерен отомстить за мать. Он знакомится с красавицей Маитель, которая является точной копией его убитой матери. Маитель предлагает продолжить путь вместе, и Тецуро принимает ее предложение.
По пути с Маитель и Тецуро происходят различные происшествия на различных экзотических планетах, во время которых они встречают различных людей и роботов. И постепенно Тецуро приходит к мысли, что механический корпус не решит его проблем и большинство людей, которые стали машинами, сожалеют о том, что они больше не люди.